MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Kinetoplastibacterium blastocrithidii TCC012E

Total Repeats: 18125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020285	TCTAG	2	10	28	37	20 %	40 %	20 %	20 %	451812605
2	NC_020285	TCC	2	6	48	53	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451812605
3	NC_020285	TGA	2	6	99	104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451812605
4	NC_020285	A	6	6	159	164	100 %	0 %	0 %	0 %	451812605
5	NC_020285	TGT	2	6	222	227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451812605
6	NC_020285	A	7	7	311	317	100 %	0 %	0 %	0 %	451812605
7	NC_020285	GCA	2	6	323	328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451812605
8	NC_020285	TAG	2	6	330	335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451812605
9	NC_020285	AGGCA	2	10	441	450	40 %	0 %	40 %	20 %	451812605
10	NC_020285	AGCT	2	8	455	462	25 %	25 %	25 %	25 %	451812605
11	NC_020285	GCT	2	6	466	471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451812605
12	NC_020285	GGA	2	6	526	531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451812605
13	NC_020285	AC	3	6	547	552	50 %	0 %	0 %	50 %	451812605
14	NC_020285	TGT	2	6	578	583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451812605
15	NC_020285	GTTAGG	2	12	598	609	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	451812605
16	NC_020285	GTT	2	6	640	645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451812605
17	NC_020285	TGA	2	6	669	674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451812605
18	NC_020285	A	6	6	679	684	100 %	0 %	0 %	0 %	451812605
19	NC_020285	TAT	2	6	685	690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451812605
20	NC_020285	GAT	2	6	715	720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451812605
21	NC_020285	T	7	7	727	733	0 %	100 %	0 %	0 %	451812605
22	NC_020285	GAA	2	6	754	759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451812605
23	NC_020285	T	7	7	760	766	0 %	100 %	0 %	0 %	451812605
24	NC_020285	ATA	2	6	802	807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451812605
25	NC_020285	TAG	2	6	849	854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451812605
26	NC_020285	TTA	2	6	928	933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451812605
27	NC_020285	AGA	2	6	966	971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451812605
28	NC_020285	T	7	7	978	984	0 %	100 %	0 %	0 %	451812605
29	NC_020285	AAG	2	6	999	1004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451812605
30	NC_020285	AAG	2	6	1094	1099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451812605
31	NC_020285	AGA	2	6	1207	1212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451812605
32	NC_020285	TATC	2	8	1249	1256	25 %	50 %	0 %	25 %	451812605
33	NC_020285	AGA	2	6	1271	1276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451812605
34	NC_020285	ATTT	2	8	1295	1302	25 %	75 %	0 %	0 %	451812605
35	NC_020285	GGT	2	6	1303	1308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451812605
36	NC_020285	ACT	2	6	1318	1323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451812605
37	NC_020285	ATG	2	6	1419	1424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451812605
38	NC_020285	TGT	2	6	1436	1441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451812606
39	NC_020285	ATT	2	6	1451	1456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451812606
40	NC_020285	TAG	2	6	1474	1479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451812606
41	NC_020285	TAA	2	6	1544	1549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451812606
42	NC_020285	ACA	2	6	1563	1568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451812606
43	NC_020285	AT	3	6	1657	1662	50 %	50 %	0 %	0 %	451812606
44	NC_020285	AGT	2	6	1683	1688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451812606
45	NC_020285	ATA	2	6	1708	1713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451812606
46	NC_020285	ATC	2	6	1727	1732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451812606
47	NC_020285	TGA	2	6	1766	1771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451812606
48	NC_020285	ATGTC	2	10	1782	1791	20 %	40 %	20 %	20 %	451812606
49	NC_020285	GCA	2	6	1871	1876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451812606
50	NC_020285	TTA	2	6	1886	1891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451812606
51	NC_020285	CTA	2	6	1972	1977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451812606
52	NC_020285	TTG	2	6	2046	2051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451812606
53	NC_020285	TGA	2	6	2060	2065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451812606
54	NC_020285	AC	3	6	2089	2094	50 %	0 %	0 %	50 %	451812606
55	NC_020285	AG	3	6	2208	2213	50 %	0 %	50 %	0 %	451812606
56	NC_020285	CTAA	2	8	2247	2254	50 %	25 %	0 %	25 %	451812606
57	NC_020285	TCA	2	6	2310	2315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451812606
58	NC_020285	CTAT	2	8	2396	2403	25 %	50 %	0 %	25 %	451812606
59	NC_020285	TAATT	2	10	2432	2441	40 %	60 %	0 %	0 %	451812606
60	NC_020285	TGT	2	6	2510	2515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451812606
61	NC_020285	AG	3	6	2620	2625	50 %	0 %	50 %	0 %	451812607
62	NC_020285	GTAT	2	8	2691	2698	25 %	50 %	25 %	0 %	451812607
63	NC_020285	CAT	2	6	2729	2734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451812607
64	NC_020285	GTT	2	6	2747	2752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451812607
65	NC_020285	TGA	2	6	2788	2793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451812607
66	NC_020285	TAG	2	6	2796	2801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451812607
67	NC_020285	GAT	2	6	2873	2878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451812607
68	NC_020285	TGC	2	6	2893	2898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451812607
69	NC_020285	TGG	2	6	2926	2931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451812607
70	NC_020285	GGT	2	6	2963	2968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451812607
71	NC_020285	GGTGTT	2	12	2975	2986	0 %	50 %	50 %	0 %	451812607
72	NC_020285	GTTT	2	8	3125	3132	0 %	75 %	25 %	0 %	451812607
73	NC_020285	T	6	6	3150	3155	0 %	100 %	0 %	0 %	451812607
74	NC_020285	ATG	2	6	3174	3179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451812607
75	NC_020285	AG	3	6	3197	3202	50 %	0 %	50 %	0 %	451812607
76	NC_020285	TAA	2	6	3214	3219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451812607
77	NC_020285	TTG	2	6	3237	3242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451812607
78	NC_020285	A	6	6	3250	3255	100 %	0 %	0 %	0 %	451812607
79	NC_020285	TTTTTC	2	12	3268	3279	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	451812607
80	NC_020285	TGG	2	6	3280	3285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451812607
81	NC_020285	TTG	2	6	3297	3302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451812607
82	NC_020285	AT	3	6	3339	3344	50 %	50 %	0 %	0 %	451812607
83	NC_020285	CTG	2	6	3366	3371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451812607
84	NC_020285	TGCAA	2	10	3397	3406	40 %	20 %	20 %	20 %	451812607
85	NC_020285	AAT	2	6	3446	3451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451812607
86	NC_020285	TGG	2	6	3466	3471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451812607
87	NC_020285	GCT	2	6	3494	3499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451812607
88	NC_020285	TAAA	2	8	3513	3520	75 %	25 %	0 %	0 %	451812607
89	NC_020285	TGA	2	6	3571	3576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451812607
90	NC_020285	GA	3	6	3580	3585	50 %	0 %	50 %	0 %	451812607
91	NC_020285	TAG	2	6	3631	3636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451812607
92	NC_020285	GTT	2	6	3715	3720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451812607
93	NC_020285	ATA	2	6	3758	3763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451812607
94	NC_020285	AG	3	6	3779	3784	50 %	0 %	50 %	0 %	451812607
95	NC_020285	GC	3	6	3788	3793	0 %	0 %	50 %	50 %	451812607
96	NC_020285	TA	4	8	3894	3901	50 %	50 %	0 %	0 %	451812607
97	NC_020285	GGT	2	6	3920	3925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451812607
98	NC_020285	TAC	2	6	4036	4041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451812607
99	NC_020285	ATC	2	6	4101	4106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451812607
100	NC_020285	TAA	2	6	4110	4115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451812607
101	NC_020285	CTGATG	2	12	4122	4133	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	451812607
102	NC_020285	TAT	2	6	4158	4163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451812607
103	NC_020285	TA	3	6	4173	4178	50 %	50 %	0 %	0 %	451812607
104	NC_020285	AATT	2	8	4191	4198	50 %	50 %	0 %	0 %	451812607
105	NC_020285	GA	3	6	4199	4204	50 %	0 %	50 %	0 %	451812607
106	NC_020285	AT	4	8	4211	4218	50 %	50 %	0 %	0 %	451812607
107	NC_020285	ACC	2	6	4225	4230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451812607
108	NC_020285	GAA	2	6	4256	4261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451812607
109	NC_020285	TTTA	2	8	4263	4270	25 %	75 %	0 %	0 %	451812607
110	NC_020285	GAT	2	6	4280	4285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451812607
111	NC_020285	TAA	2	6	4329	4334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451812607
112	NC_020285	GTG	2	6	4359	4364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451812607
113	NC_020285	T	7	7	4368	4374	0 %	100 %	0 %	0 %	451812607
114	NC_020285	ATT	2	6	4409	4414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451812607
115	NC_020285	AGA	2	6	4415	4420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451812607
116	NC_020285	GATATA	2	12	4472	4483	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451812607
117	NC_020285	AGA	2	6	4489	4494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451812607
118	NC_020285	CTG	2	6	4509	4514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451812607
119	NC_020285	T	6	6	4516	4521	0 %	100 %	0 %	0 %	451812607
120	NC_020285	TCA	2	6	4541	4546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451812607
121	NC_020285	TGA	2	6	4579	4584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451812607
122	NC_020285	ATAG	2	8	4637	4644	50 %	25 %	25 %	0 %	451812607
123	NC_020285	T	6	6	4648	4653	0 %	100 %	0 %	0 %	451812607
124	NC_020285	TA	3	6	4667	4672	50 %	50 %	0 %	0 %	451812607
125	NC_020285	GA	3	6	4713	4718	50 %	0 %	50 %	0 %	451812607
126	NC_020285	GAAAA	2	10	4757	4766	80 %	0 %	20 %	0 %	451812607
127	NC_020285	AAC	2	6	4827	4832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451812607
128	NC_020285	GA	3	6	4848	4853	50 %	0 %	50 %	0 %	451812607
129	NC_020285	ACA	2	6	4877	4882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451812607
130	NC_020285	ATT	2	6	4945	4950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451812607
131	NC_020285	TAC	2	6	4951	4956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451812607
132	NC_020285	GAT	2	6	4967	4972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451812607
133	NC_020285	GA	3	6	4984	4989	50 %	0 %	50 %	0 %	451812607
134	NC_020285	AAT	2	6	5000	5005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451812607
135	NC_020285	CAA	2	6	5016	5021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451812607
136	NC_020285	AT	3	6	5028	5033	50 %	50 %	0 %	0 %	451812607
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402	NC_020285	TAG	2	6	16950	16955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451812616
403	NC_020285	ATC	2	6	16957	16962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451812616
404	NC_020285	TTA	2	6	16991	16996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451812616
405	NC_020285	TTA	2	6	17022	17027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451812616
406	NC_020285	AT	3	6	17054	17059	50 %	50 %	0 %	0 %	451812616
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